Mia Khalifa werd geboren op 10 februari 1993 in Beiroet, Libanon en verhuisde in januari 2001 met haar gezin naar de Verenigde Staten, en verliet hun huis na het conflict in Zuidelijk Libanon. Haar familie is katholiek en ze groeide op met de religie, in wat ze omschrijft als een ‘zeer conservatief’ huis, hoewel ze de religie niet langer beoefent.
Khalifa ging naar een Franse privéschool in Beiroet, waar ze Engels leerde spreken. Nadat ze naar de Verenigde Staten was verhuisd, woonde ze in Montgomery County, Maryland en speelde lacrosse op de middelbare school. Khalifa ging een tijd later naar Northwest High School. Khalifa heeft gepraat over gepest worden op de middelbare school omdat ze ‘het donkerste en raarste meisje daar’ was, dat vooral na de aanslagen op 11 september verergerde.
Khalifa ging daarna naar de militaire academie van Massanutten en verhuisde vervolgens naar Texas om naar de universiteit te gaan. Ze studeerde af aan de Universiteit van Texas in El Paso met een Bachelor of Arts-graad in Geschiedenis.
